163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5354 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  72.04 
 
 		 183 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  72.04 
 
 		 183 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  71.51 
 
 		 183 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  74.05 
 
 		 183 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  46.49 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.7 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 200 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  45.61 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.51 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.86 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  30.89 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 370 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  21.89 
 
 		 442 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.82 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.11 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.35 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  20.9 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  27.55 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40 
 
 		 452 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  41.77 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.32 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  24.6 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.42 
 
 		 369 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  39.24 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  30.5 
 
 		 383 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.41 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.72 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 261 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 261 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  22.94 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.84 
 
 		 365 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.84 
 
 		 365 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 391 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.84 
 
 		 365 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 440 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  33.94 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  31.91 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  30.26 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  23.44 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  27.98 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.86 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.48 
 
 		 382 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.78 
 
 		 356 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>