183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4753 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  98.91 
 
 		 183 aa  360  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  72.04 
 
 		 185 aa  256  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  69.23 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  49.17 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  42.46 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  41.34 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  42.39 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  42.23 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 411 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 366 aa  68.2  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.47 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.96 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.83 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.27 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.05 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.76 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.03 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.11 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.54 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  30.53 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.54 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 448 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.49 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  29.82 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 212 aa  51.2  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  25.29 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40 
 
 		 452 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  30.92 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  23.95 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 445 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 447 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  29.45 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  32.58 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.4 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.4 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 402 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  33.07 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 251 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>