More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6613 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 198 aa  386  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  76.77 
 
 		 197 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 		 191 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.69 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  46.81 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  46.81 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  44.21 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  45.03 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  44.15 
 
 		 195 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  38.02 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  42.62 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  40.44 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  41.97 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  38.78 
 
 		 237 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  42.05 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.8 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 440 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 391 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.51 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.86 
 
 		 442 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 412 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  24.32 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.5 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.95 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.83 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.72 
 
 		 427 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.71 
 
 		 442 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  24.21 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.59 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  24.21 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  29.57 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.96 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.69 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.29 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.96 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.09 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  28.35 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 402 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>