More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1895 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  69.68 
 
 		 191 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.65 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 		 253 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  38.19 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  40.98 
 
 		 249 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  40.49 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.78 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  38.42 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 226 aa  94.4  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  36.84 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  40.56 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.58 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 261 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34 
 
 		 378 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.7 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  31.74 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.4 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  38.71 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.05 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  26 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.7 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.81 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.56 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  41 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  32.14 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  30.25 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 370 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.05 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 591 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>