206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5099 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  72.12 
 
 		 262 aa  341  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  69 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  68.56 
 
 		 251 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  65.37 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  54.67 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  55.19 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.07 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 191 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 192 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  30.65 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  27.92 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.64 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.22 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.56 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  27.41 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  25.86 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.95 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  23.96 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 412 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  23.78 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  27.08 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  27.15 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  23.2 
 
 		 177 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.03 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.03 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  22.63 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  22.63 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  22.99 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  28.97 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  26.11 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.84 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  32.22 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  22.22 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  24.7 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.97 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  31.07 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30400  predicted protein  33.33 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.923581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  24.16 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  25.33 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>