More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0904 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 190 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  51.08 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 192 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  46.03 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  46.03 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.67 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.33 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.24 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.1 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 		 591 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.13 
 
 		 369 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.86 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.56 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.33 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 411 aa  68.2  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.61 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.92 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.92 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.92 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.23 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.8 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.85 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  33.33 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  34.39 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.76 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.62 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.14 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.14 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  31.76 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.14 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.9 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  30.39 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 241 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  30.98 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  28.42 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.93 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 412 aa  62  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  28.96 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  28.96 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 232 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  32.34 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.8 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  35.29 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  28.33 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>