More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0480 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  78.65 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  78.65 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  50.79 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  55.08 
 
 		 190 aa  174  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 190 aa  161  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 253 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 251 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 251 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 262 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  32.62 
 
 		 235 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.35 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.73 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.78 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  37.59 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.43 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 214 aa  72  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 402 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.29 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.97 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.74 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  24.75 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.71 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.14 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  36.48 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  37.11 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.98 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.81 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  32.8 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.56 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.67 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  33.96 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.17 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  27.57 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.41 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.85 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.84 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 		 412 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  33 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.82 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.65 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  33 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  37.39 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  37.39 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  33 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.28 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  33 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  25.38 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>