More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0862 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  45.41 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  43.37 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 		 277 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  36.25 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.51 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.51 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.48 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.98 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.98 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  34.84 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  33.75 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.09 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  33.12 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.55 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.57 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.9 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.34 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.65 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  31.15 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.21 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  34.59 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.43 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  32.39 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  35.9 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.29 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  25.33 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  25.71 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.98 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  20.5 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  25.71 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  25.71 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  25.71 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  25.71 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.42 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  25.84 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  25.89 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>