237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0739 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  70.72 
 
 		 184 aa  256  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  55.43 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  50.79 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  57.78 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  50.84 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  48.66 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  48.68 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.54 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.56 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  36.93 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 195 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  37.71 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  43.51 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  41.03 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  35.43 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  41.03 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  41.03 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  41.03 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  41.03 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  41.03 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  41.03 
 
 		 616 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  42.21 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  42.21 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  34.29 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  37.11 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  39.62 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  40.38 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  36.46 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  33.33 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  35 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  37.6 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.55 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  34.31 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.77 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  40.38 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.62 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 412 aa  58.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.33 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.69 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  31.13 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.03 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.03 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  36.72 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  32.5 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  35.04 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.13 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.49 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  33.53 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.04 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.49 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.49 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 232 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.21 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.49 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  27.61 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.48 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.21 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.21 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 389 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  30.61 
 
 		 235 aa  51.2  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>