More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5528 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
195 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  72.54 
 
 
198 aa  270  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  72.02 
 
 
198 aa  254  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  72.02 
 
 
207 aa  253  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  59.69 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  61.26 
 
 
197 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  45.55 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  48.65 
 
 
196 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  47.4 
 
 
196 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 
196 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  43.23 
 
 
217 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  45.55 
 
 
194 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 
196 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 
197 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  46.63 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  44.74 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  46.39 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  46.5 
 
 
197 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.56 
 
 
197 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 
210 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.11 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40.31 
 
 
222 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 
222 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.27 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  34.3 
 
 
197 aa  84.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  43.11 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.31 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.75 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
208 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.3 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  32.81 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.12 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  37.3 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  29.69 
 
 
443 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.72 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  32.3 
 
 
658 aa  75.1  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.74 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  35.54 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.12 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  39.2 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  43.27 
 
 
440 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
235 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  34.91 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.46 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  38.46 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.46 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>