199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0656 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  97.04 
 
 		 203 aa  393  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  58.01 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  52.6 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  49.21 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  48.66 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  49.17 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  45.86 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  40.56 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  39.38 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  38.12 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 174 aa  85.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.36 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  37.18 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  25.81 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  35.39 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  34.04 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  36.16 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.1 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  28.1 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  36.31 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  36.31 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  36.31 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  35.87 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  31.48 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 616 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  39.1 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  34.95 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  35.67 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  29.74 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  36.22 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.81 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.44 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.91 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  29.82 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.56 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.48 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  26.88 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.78 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.95 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  27.39 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  27.37 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  33.96 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  35.15 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.15 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.61 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  20 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  27.97 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 591 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.16 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>