More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2250 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
195 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  53.09 
 
 
193 aa  191  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  43.46 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  45.25 
 
 
207 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.63 
 
 
201 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  44.94 
 
 
207 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 
201 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  45.35 
 
 
194 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  44.77 
 
 
194 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 
206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 
190 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  39.78 
 
 
189 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 
188 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  41.57 
 
 
188 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  41.01 
 
 
188 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  41.11 
 
 
217 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.37 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  43.37 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.2 
 
 
191 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  41.28 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  40.91 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  43.05 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.51 
 
 
197 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 
203 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
215 aa  97.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.75 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  32.75 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.75 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.16 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  32.75 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.16 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  32.74 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  28.93 
 
 
213 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
239 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
239 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  31.58 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
247 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.65 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
243 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.99 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30.99 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.99 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.18 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.66 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.79 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  30.99 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.99 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.1 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  33.14 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.02 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  33.14 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.82 
 
 
452 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.14 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  36.67 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.06 
 
 
249 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 
411 aa  74.7  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  29.65 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
440 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  32.42 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  31.21 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.82 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.57 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  26.95 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.64 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>