More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5377 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  40.46 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  37.64 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  36.84 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  38.27 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  34.24 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 196 aa  97.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  33.7 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  33.7 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  33.7 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  33.7 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  33.7 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  33.7 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  34.08 
 
 		 616 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 202 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  35.95 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  32.78 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  35.56 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  32.22 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  31.67 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.65 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  29.94 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.87 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.61 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  32.6 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  32.78 
 
 		 195 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.6 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.56 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  34.85 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 411 aa  67.4  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.04 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  34.56 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  31.25 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 		 591 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.16 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.82 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.01 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  29.92 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.85 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  28.85 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  29.08 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.28 
 
 		 378 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.6 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  33.57 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  28.76 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.26 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>