95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0521 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  100 
 
 		 183 aa  360  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  58.62 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  48.91 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  40.23 
 
 		 200 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  23.5 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  26.28 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  31.95 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  31.95 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  39.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  39.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  39.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  30.13 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  39.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  39.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  39.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.02 
 
 		 452 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  37.75 
 
 		 616 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  30.77 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  37.61 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  36.7 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.51 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  27.92 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.93 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  33.56 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.65 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 370 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.06 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  33.04 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 401 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 366 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  36.3 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  30.88 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  33.02 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  36.25 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 402 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.34 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  29.45 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 411 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.19 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 391 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.67 
 
 		 378 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 201 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 190 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 378 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  33.02 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  30.11 
 
 		 277 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 218 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  33.02 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  33.02 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>