More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0700 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 
202 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  98.51 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  98.02 
 
 
202 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  98.02 
 
 
213 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  98.51 
 
 
202 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  75.76 
 
 
203 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  75.76 
 
 
203 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  75.76 
 
 
203 aa  323  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  75.76 
 
 
203 aa  323  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  75.76 
 
 
203 aa  323  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  74.24 
 
 
203 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  75.25 
 
 
203 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  74.24 
 
 
203 aa  317  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
214 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.95 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.95 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.95 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
210 aa  95.1  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.26 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
256 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
212 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
212 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.58 
 
 
203 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.95 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.03 
 
 
378 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
211 aa  84.7  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 
391 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
190 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.53 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.27 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.26 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
447 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.17 
 
 
442 aa  81.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.66 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  33.14 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.82 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.96 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.26 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.14 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.84 
 
 
443 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
213 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.22 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.14 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0838  phosphoglycerate mutase  26.46 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000172405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  29.38 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  29.08 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  29.08 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  29.08 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.71 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.36 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  31.79 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 
378 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>