More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1411 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  33.69 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 185 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  34.15 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  34.9 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  32.94 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  32.93 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  36.14 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  32.32 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  32.32 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  32.32 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  32.32 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  32.32 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  35.76 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  32.32 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  32.32 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  32.5 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  30.85 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  26.63 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.32 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  35.98 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.5 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  26.63 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  26.13 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  26.13 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.13 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.13 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.13 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.12 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.13 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.63 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  27.64 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  27.64 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  27.64 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  30.1 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  27.64 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  27.14 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  28.22 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.59 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.26 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 411 aa  58.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  23.86 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>