More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3923 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
194 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  90.86 
 
 
194 aa  352  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  49.47 
 
 
193 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  50.26 
 
 
198 aa  171  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 
194 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  48.15 
 
 
198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  44.26 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 
223 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  45.11 
 
 
196 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.09 
 
 
210 aa  157  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  44.92 
 
 
193 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  47.12 
 
 
195 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
238 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  44.09 
 
 
193 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  43.96 
 
 
203 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  43.96 
 
 
203 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  43.96 
 
 
203 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  43.41 
 
 
191 aa  148  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  43.16 
 
 
227 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  47.31 
 
 
203 aa  147  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  44.32 
 
 
203 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 
206 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 
212 aa  143  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  41.71 
 
 
228 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 
200 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  41.36 
 
 
193 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  45.19 
 
 
215 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 
200 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  36.54 
 
 
234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  45.08 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  42.39 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  37.22 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  42.41 
 
 
240 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
206 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  41.28 
 
 
236 aa  121  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  39.07 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  46.09 
 
 
178 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
244 aa  112  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  34.48 
 
 
239 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  36.63 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.05 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  36.05 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  36.05 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  35.47 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  35.47 
 
 
203 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  35.47 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  37.65 
 
 
202 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  35.67 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  38.24 
 
 
202 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  37.65 
 
 
202 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  37.65 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  37.65 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  41.35 
 
 
159 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.15 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
226 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.9 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.2 
 
 
443 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.98 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.62 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.98 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.98 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
452 aa  74.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.98 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1904  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  29.15 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  29.5 
 
 
227 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  30.73 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.46 
 
 
378 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  36.14 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.52 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.52 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>