More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1372 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  66.15 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  58.03 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  58.25 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  56.02 
 
 		 203 aa  195  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  57.14 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  55.21 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  54.97 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  55.96 
 
 		 193 aa  184  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  51.32 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  50.28 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  49.21 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  48.44 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  50.52 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  45.26 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  45.27 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  47.12 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  43.18 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.74 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  39.45 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  46.28 
 
 		 200 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  43.14 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  40.91 
 
 		 236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  56.34 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  45.08 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  45.3 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  44.56 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  44.2 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  43.09 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  45.64 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  45.13 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  45.13 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  46.07 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  46.28 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  35.32 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  41.88 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  39.06 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  34.1 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.43 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.41 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.44 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.44 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.44 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.04 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.4 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  29.81 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  32.45 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.96 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.62 
 
 		 378 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.48 
 
 		 442 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.34 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  27.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  27.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  27.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.93 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  27.43 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  27.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.05 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>