More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1504 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  60 
 
 
236 aa  271  8.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  47.47 
 
 
212 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  43.52 
 
 
215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  42.4 
 
 
198 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 
193 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  40.37 
 
 
194 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 
194 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 
193 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 
200 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  38.81 
 
 
200 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  39.35 
 
 
198 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 
203 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 
193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  35.14 
 
 
240 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 
206 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
193 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
189 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 
202 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  36.95 
 
 
195 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  32.72 
 
 
196 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 
190 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
200 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 
178 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  35.91 
 
 
203 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  35.91 
 
 
203 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  36.46 
 
 
203 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  30.74 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  35.14 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  33.88 
 
 
227 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  34.43 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  30.12 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  31.3 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  34.85 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
214 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  33.85 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.75 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  32.29 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  27.94 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.02 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.56 
 
 
378 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  30.5 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.03 
 
 
442 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
249 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.52 
 
 
200 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.08 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  32.66 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  32.29 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.52 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.52 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  34 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  30.96 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.65 
 
 
442 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.36 
 
 
442 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.11 
 
 
442 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  28.22 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  28.8 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  29.85 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  30.65 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  33.16 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.47 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  31.31 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  31.31 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  31.41 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
293 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  31.31 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  32.5 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  30.5 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  31.31 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  31.31 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  31.31 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>