More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0743 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  64.71 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  50.54 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  47.37 
 
 		 200 aa  174  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  48.45 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  44.86 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  44.09 
 
 		 194 aa  160  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 		 194 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  44.92 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  43.85 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  44.09 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  43.81 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  43.81 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  45.11 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  46.49 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  46.49 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  44.74 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  36.4 
 
 		 238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  40 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  39.8 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  40.33 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  39.3 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  39.3 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  38.02 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  37 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  36.92 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  40.21 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  32.16 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  34.86 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  44.85 
 
 		 178 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  33.33 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 244 aa  92  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  31.03 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.26 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.72 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.88 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.88 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  28.72 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  34.01 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  38.53 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.42 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  26.71 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.09 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.87 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.09 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  36.7 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.04 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.04 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.04 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  26.67 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  28.26 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.98 
 
 		 378 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  28.95 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>