More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0155 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  44.27 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  46.39 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.68 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  46.49 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  44.27 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  44.27 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  43.75 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  40.32 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  39.69 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  40.22 
 
 		 227 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  39.27 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  37.02 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  37.36 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  34.51 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  32.68 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  36.32 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  34.66 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 244 aa  99  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  35.02 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  43.59 
 
 		 159 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 		 178 aa  89  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  31.48 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.07 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  26.21 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.32 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.63 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25.5 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.62 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.62 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.28 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.49 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.38 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.89 
 
 		 378 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.82 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.1 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.78 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.57 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>