42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4366 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  52.78 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  55.77 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  53.4 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  52.43 
 
 		 193 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  43.59 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  47.62 
 
 		 191 aa  90.9  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  45.28 
 
 		 200 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  43.4 
 
 		 203 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  44.23 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  36 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 200 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  41.18 
 
 		 203 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  43.12 
 
 		 193 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 194 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  43.4 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  39.67 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  36.89 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  41.23 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  39.22 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  39.05 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  39.05 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  38.1 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  43.69 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.53 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  34.23 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  39.64 
 
 		 195 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 202 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  36.84 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  33.94 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 212 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  36.14 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7018  hypothetical protein  41.82 
 
 		 72 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>