More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3818 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 445 aa  101  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 370 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 206 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.32 
 
 		 442 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.84 
 
 		 442 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.14 
 
 		 442 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 448 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.72 
 
 		 369 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.63 
 
 		 442 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.37 
 
 		 443 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 448 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 241 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.86 
 
 		 442 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 411 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.38 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 389 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.72 
 
 		 356 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 440 aa  84.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.42 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 449 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.27 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  31.55 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  32.35 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.83 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.83 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.37 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.27 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.83 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.74 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.16 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.27 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>