More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6284 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  49.74 
 
 		 195 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  49.75 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  49.75 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  49.75 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  50.79 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  48.66 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  47.59 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  49.21 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 190 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.32 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  46.03 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 		 200 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  45.73 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  40.82 
 
 		 210 aa  148  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  48.74 
 
 		 193 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  43.55 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  44.21 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  45.03 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  47.76 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  42.63 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  47.09 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  35.19 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  46.07 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  43.84 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  41.45 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  35.19 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  36.54 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  36.06 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  37.23 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  44.36 
 
 		 178 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.29 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.83 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.83 
 
 		 442 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.83 
 
 		 442 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.24 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 448 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 447 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  31.15 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 448 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 412 aa  74.7  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.99 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.09 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  29.09 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  29.71 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  24 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.21 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  35.06 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.38 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 449 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.71 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  34.66 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.02 
 
 		 442 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>