More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2379 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 203 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  84.73 
 
 		 200 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  60.73 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  58.97 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  56.92 
 
 		 195 aa  204  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  57.65 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  56.02 
 
 		 193 aa  195  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  47.83 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  53.51 
 
 		 190 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 189 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  51.06 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  53.72 
 
 		 194 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  46.49 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  49.23 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  52.41 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.23 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  59.29 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  45.99 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  47.31 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  41.33 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  46.32 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  44.86 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  40.82 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  43.52 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  43.52 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  43.52 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  43.63 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 		 234 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  43.62 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  40.68 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  37.63 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  37.22 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  36.94 
 
 		 237 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  34.1 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  43.4 
 
 		 159 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.55 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  41.09 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.89 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.89 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.15 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.69 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.69 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.28 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  23.47 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 411 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  30.32 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  31.82 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.25 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.41 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.25 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.68 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>