More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0078 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  99.03 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  35.64 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  35.15 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  35.64 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  35.64 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  35.64 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  36.14 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  35.15 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  36.14 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  36.46 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.7 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.16 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 202 aa  98.6  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.72 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  27.44 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.12 
 
 		 442 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.12 
 
 		 442 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.5 
 
 		 442 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.04 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 240 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  36.9 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 449 aa  91.3  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  30.67 
 
 		 160 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.72 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 260 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  29.67 
 
 		 223 aa  88.2  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  31.58 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  23.47 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 448 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  29.09 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  25.59 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35 
 
 		 442 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.1 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.1 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 447 aa  85.9  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 448 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 440 aa  85.1  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 		 235 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  30.52 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.49 
 
 		 442 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  30.63 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.89 
 
 		 442 aa  84.7  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.36 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  28.14 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  30.5 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>