More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0578 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  56.92 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  56.38 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  55.85 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  55.85 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  56.38 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  54.79 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 212 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 212 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  55.32 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  53.72 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  53.68 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  51.81 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  53.72 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  46.33 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  50.52 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  54.01 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  52.41 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  45.12 
 
 		 253 aa  188  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.15 
 
 		 249 aa  187  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 		 250 aa  187  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  53.48 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  45.41 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  51.34 
 
 		 211 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  44.35 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  45.87 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 250 aa  181  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 250 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 250 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  44.5 
 
 		 249 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  44.04 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  43.58 
 
 		 247 aa  178  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  44.19 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  42.66 
 
 		 250 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 249 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  43.58 
 
 		 248 aa  176  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  49.48 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  43.12 
 
 		 247 aa  174  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  43.12 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.45 
 
 		 235 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50.55 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  42.2 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  44.6 
 
 		 246 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  50 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  43.58 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  42.33 
 
 		 247 aa  171  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  43.26 
 
 		 229 aa  171  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 		 248 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 		 248 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  43.58 
 
 		 247 aa  171  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  42.2 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  41.78 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 247 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  40.37 
 
 		 248 aa  169  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  40.83 
 
 		 248 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  42.2 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  43.12 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.06 
 
 		 245 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  43.12 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 		 237 aa  167  8e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  40.81 
 
 		 226 aa  166  1e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  42.25 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  42.2 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>