More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1028 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  384  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  66.15 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  56.63 
 
 		 223 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  56.25 
 
 		 198 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  53.54 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  51.79 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  51.53 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  47.45 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  48.21 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  48.73 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  50.25 
 
 		 240 aa  153  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  50.73 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  48.97 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  47.18 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  40.49 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  46.67 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  44.21 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  51.35 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.88 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  49.48 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  49.23 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  46.91 
 
 		 190 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  48.24 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  53.47 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  38.29 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  44.21 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  38.81 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  46 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  43.56 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  47.87 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  47.87 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  44.69 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  37.39 
 
 		 239 aa  117  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  47.34 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  41.36 
 
 		 228 aa  111  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  41.41 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  41.41 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  42.33 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  41.18 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.99 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.24 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 445 aa  78.6  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.12 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.92 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.16 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 402 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.26 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.92 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.78 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.78 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.71 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.73 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.71 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.88 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.94 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.31 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.71 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.78 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.71 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.29 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>