More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1234 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  68.88 
 
 		 249 aa  321  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  49.25 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 		 204 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  45.27 
 
 		 210 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  44.98 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  40.3 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.59 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  39.3 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.17 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.1 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.62 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  38.98 
 
 		 459 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  41.01 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  38.81 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  42.94 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  39.36 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 447 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 449 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.63 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 204 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 412 aa  95.5  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  35.43 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  43.22 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.86 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.86 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  34.48 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  36.68 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.93 
 
 		 378 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 448 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.48 
 
 		 442 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.64 
 
 		 442 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.84 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.13 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  36.26 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.75 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 452 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.74 
 
 		 442 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  40.44 
 
 		 402 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 370 aa  81.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  39.26 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.16 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.74 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  34.3 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.9 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.65 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  40.46 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>