More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3358 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  59.9 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  59.41 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 		 207 aa  214  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  52.17 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  53.96 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  44.85 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  43.56 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  46 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  48.26 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  40.51 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  42.08 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  40.8 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 445 aa  98.6  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.14 
 
 		 382 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.54 
 
 		 442 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  31.91 
 
 		 272 aa  91.7  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 240 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.94 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  31.45 
 
 		 281 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 449 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  41.25 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  41.33 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.56 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.32 
 
 		 442 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.99 
 
 		 227 aa  87.8  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.58 
 
 		 442 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.84 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.32 
 
 		 442 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.93 
 
 		 442 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 216 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.42 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.1 
 
 		 442 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>