More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3852 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
200 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  84.92 
 
 
206 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  46.19 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  49.24 
 
 
218 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 
208 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  45.96 
 
 
204 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  46 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  45.23 
 
 
243 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  42.08 
 
 
210 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  48.73 
 
 
228 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  42.29 
 
 
232 aa  138  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  42.29 
 
 
249 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  42.36 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  41.58 
 
 
203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 
234 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.16 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 
232 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  47.71 
 
 
218 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 
204 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  38 
 
 
215 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  44.08 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  42.48 
 
 
226 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
208 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  42.48 
 
 
226 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  43.79 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40.86 
 
 
222 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 
213 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 
222 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  44.08 
 
 
229 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  46.05 
 
 
233 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 
234 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  44.08 
 
 
240 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
225 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 
223 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  41.72 
 
 
202 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 
214 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
224 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
218 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 
223 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 
212 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.37 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
215 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  37.33 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  44.24 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  50.94 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  40.88 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 
220 aa  95.5  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
223 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
227 aa  95.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.97 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37 
 
 
212 aa  94.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 
227 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  38.17 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.89 
 
 
378 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
370 aa  91.7  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.11 
 
 
369 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 
224 aa  91.3  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 
220 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.22 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  38.22 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.22 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  38.22 
 
 
229 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 
207 aa  89  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
209 aa  87.8  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  37.69 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.46 
 
 
382 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>