More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1510 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  48.04 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  46.97 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  46.7 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  47.45 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  48.78 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  41.12 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 		 232 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  41.12 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  43.84 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  40.76 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.3 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  46.71 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.02 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  41.06 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  42 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  40.65 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  42 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  32.13 
 
 		 281 aa  99  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  45.81 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  39.87 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 		 213 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  38 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  40.79 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  47.37 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  46.71 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 412 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  40.36 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  38.02 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  33.19 
 
 		 272 aa  94.7  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 370 aa  94.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 445 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  36.65 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.99 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  36.65 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  36.65 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  37.27 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  36 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  41.13 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  36.02 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 449 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  43.26 
 
 		 402 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.43 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.43 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 378 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 		 440 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 256 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 448 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 447 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>