More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5474 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  45.64 
 
 
207 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  46.19 
 
 
200 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  45.41 
 
 
208 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  45.73 
 
 
204 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  43.08 
 
 
218 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 
243 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 
207 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  43.08 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 
228 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.16 
 
 
234 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  39.8 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  40 
 
 
203 aa  131  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38.59 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  41.12 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  39.59 
 
 
232 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  48 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
223 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  43.79 
 
 
226 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  43.79 
 
 
226 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.04 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  43.12 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  43.87 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  34.93 
 
 
272 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  46.67 
 
 
229 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  44 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  40.37 
 
 
202 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  42.76 
 
 
240 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 
234 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 
445 aa  104  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  40.67 
 
 
212 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
220 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  40.11 
 
 
210 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
224 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 
209 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  41.14 
 
 
223 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  42.48 
 
 
224 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  41.67 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  40.67 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
208 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 
220 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  41.67 
 
 
220 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  41.67 
 
 
229 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  41.67 
 
 
220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  32.39 
 
 
232 aa  98.2  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.75 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
220 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  40.79 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  41.14 
 
 
229 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.48 
 
 
382 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 
211 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 
227 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 
207 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.38 
 
 
442 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.56 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 
447 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
210 aa  92  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
223 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
214 aa  91.7  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.81 
 
 
442 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.9 
 
 
449 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
223 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
211 aa  89  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
448 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.46 
 
 
442 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 
220 aa  88.2  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  41.06 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.51 
 
 
442 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>