More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3506 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 
224 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.8 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  35.83 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
215 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.83 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.43 
 
 
220 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
215 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
215 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
215 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 
224 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.76 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
226 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
205 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  37.63 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
215 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 
207 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.38 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.81 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.39 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.98 
 
 
383 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  29.9 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  32.89 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.65 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  34.66 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>