More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2083 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 412 aa  811    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  42.46 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  42.32 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.64 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  41.75 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.36 
 
 		 378 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.68 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  42.59 
 
 		 363 aa  223  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  51.82 
 
 		 243 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  39.95 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.95 
 
 		 369 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  41.63 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.56 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.06 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.06 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.06 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  43 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  67.97 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  65.35 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  63.08 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  60.61 
 
 		 137 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  57.25 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 440 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.81 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  41.73 
 
 		 253 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  41.73 
 
 		 168 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  41.73 
 
 		 253 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 232 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 204 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 218 aa  94.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  46.21 
 
 		 133 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  43.75 
 
 		 142 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  37.78 
 
 		 203 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  45.24 
 
 		 132 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  40.69 
 
 		 211 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 212 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 225 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 212 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.55 
 
 		 222 aa  90.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 222 aa  90.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  40.94 
 
 		 254 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  41.13 
 
 		 198 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  34.18 
 
 		 313 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 232 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  42.97 
 
 		 197 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 258 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  38.64 
 
 		 194 aa  86.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 212 aa  86.7  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12100  fructose-2,6-bisphosphatase  35.96 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0451501  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 234 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  30.66 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.42 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  32.04 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.24 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  34.85 
 
 		 134 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  42.19 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  43.2 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  33.67 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.07 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  39.13 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.22 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 213 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 201 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.64 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 189 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  38.89 
 
 		 126 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>