More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1908 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 208 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  53.27 
 
 		 213 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  49.75 
 
 		 205 aa  214  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  47.8 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 209 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  37.69 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  37.69 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  37.69 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  40.49 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 445 aa  141  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 459 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  37 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  37.5 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 440 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 448 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  36.6 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.12 
 
 		 443 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 200 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 207 aa  131  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  38.38 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.47 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.31 
 
 		 442 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 447 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 452 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.89 
 
 		 442 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 448 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 447 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  33.84 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.86 
 
 		 547 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  37.25 
 
 		 383 aa  124  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 411 aa  124  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.79 
 
 		 442 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.61 
 
 		 442 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 449 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.8 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 363 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.45 
 
 		 444 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 		 442 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.83 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.82 
 
 		 227 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.82 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.37 
 
 		 442 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 378 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.35 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.88 
 
 		 442 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.02 
 
 		 427 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  38.25 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>