More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3895 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  97.98 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  56 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  54.5 
 
 		 200 aa  224  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  53.5 
 
 		 202 aa  211  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  50.5 
 
 		 200 aa  207  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  52.28 
 
 		 213 aa  207  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 		 591 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 256 aa  117  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.47 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  36.27 
 
 		 223 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  34.72 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.9 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 440 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 411 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 378 aa  88.6  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 209 aa  87.8  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  35.5 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.26 
 
 		 382 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.29 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 224 aa  84.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.55 
 
 		 452 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.59 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.72 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.72 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  32.26 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  34.32 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.1 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.72 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.65 
 
 		 442 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  30.6 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  23.86 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.08 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.66 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.96 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.65 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>