More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2181 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
452 aa  932    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  62.64 
 
 
447 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  62.66 
 
 
449 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  59.96 
 
 
448 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  59.74 
 
 
448 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  58.04 
 
 
447 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  55.82 
 
 
459 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  55.58 
 
 
445 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  46.72 
 
 
444 aa  392  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  46.29 
 
 
442 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  43.98 
 
 
443 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  44.96 
 
 
442 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  46.21 
 
 
547 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  41.79 
 
 
442 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  43.33 
 
 
442 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  45.51 
 
 
442 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  42.58 
 
 
442 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  41.7 
 
 
442 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  43.09 
 
 
214 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
214 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
214 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35517  predicted protein  41.27 
 
 
220 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0923281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 
214 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
214 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
213 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
208 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
213 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
213 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.95 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.67 
 
 
213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.37 
 
 
200 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.37 
 
 
200 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.88 
 
 
200 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.7 
 
 
197 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 
204 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  34.69 
 
 
196 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
209 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 
370 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
235 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  30.81 
 
 
223 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
200 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
202 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
211 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
209 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
200 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.07 
 
 
222 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 
222 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 
241 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
209 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
212 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
207 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
209 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
207 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
207 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 
206 aa  92.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
223 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
220 aa  90.5  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
201 aa  90.5  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 
256 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
240 aa  90.1  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
240 aa  90.1  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
223 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
193 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  32.22 
 
 
217 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 
402 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 
207 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
221 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 
218 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
215 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.55 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
200 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  29.8 
 
 
214 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
188 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
226 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  31.02 
 
 
203 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
200 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
226 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
217 aa  87  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
237 aa  87  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
220 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.48 
 
 
203 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.48 
 
 
203 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
223 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
197 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
221 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
220 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
221 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
591 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.23 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
201 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
201 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.72 
 
 
203 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.65 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.95 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>