More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0114 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.81 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 		 188 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.12 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 447 aa  98.6  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.53 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.53 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.53 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.53 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.53 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0838  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000172405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.92 
 
 		 442 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.53 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  30.2 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 449 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.33 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.17 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.7 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.66 
 
 		 442 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.66 
 
 		 442 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.99 
 
 		 442 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.44 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.22 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.58 
 
 		 442 aa  89  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.7 
 
 		 442 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.72 
 
 		 442 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.41 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.93 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.63 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.93 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  33.76 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>