More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3528 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  82.1 
 
 		 225 aa  332  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  79.65 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  79.91 
 
 		 224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  68.04 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  67.89 
 
 		 220 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  52.07 
 
 		 203 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  47.93 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  44.56 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  45.31 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 		 198 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 		 208 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  31.42 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.6 
 
 		 382 aa  99.4  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  35 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.27 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.29 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.88 
 
 		 369 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 195 aa  92.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.98 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  36.16 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  28.51 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 370 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30400  predicted protein  36.57 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.923581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  32.3 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.65 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.28 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.65 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.65 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.05 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.86 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.18 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  31.13 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  44.29 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.36 
 
 		 427 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 412 aa  78.2  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  29.71 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>