More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1664 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 
211 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.13 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
207 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
232 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.15 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  44.63 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 
226 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.98 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  38 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.78 
 
 
443 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.12 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.12 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.12 
 
 
200 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
209 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
214 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
207 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
448 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
448 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.73 
 
 
442 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  27.09 
 
 
370 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
205 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.55 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.52 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.73 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.15 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.89 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  38.53 
 
 
198 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  29.45 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.25 
 
 
442 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  31.84 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  41.73 
 
 
196 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  41.73 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.38 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.18 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  32.14 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>