More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2679 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 196 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  99.49 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  47.69 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  46.84 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  29.53 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.81 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.85 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.28 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.3 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.21 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.3 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.73 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.32 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.73 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.95 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.73 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  41.73 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  36.31 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  30.12 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  29.27 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 391 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  39.66 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  30.39 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  33.71 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  32.32 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  29.82 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.67 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  30.34 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.03 
 
 		 383 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.09 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>