More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1815 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  35.98 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 		 591 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  36.9 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  40.11 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  42.24 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.16 
 
 		 226 aa  94.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.17 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  38.51 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  31.09 
 
 		 217 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.79 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  36.78 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  36.78 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  36.78 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 401 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  33.16 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  36.72 
 
 		 208 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.91 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 232 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  36.21 
 
 		 229 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 253 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 223 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.8 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  37.08 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.11 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 378 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  40.23 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 449 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.52 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.8 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>