More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0479 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 229 aa  463  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  86.61 
 
 		 224 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  67.44 
 
 		 226 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  67.44 
 
 		 226 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  65.73 
 
 		 227 aa  284  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  50.46 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  49.77 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  52.91 
 
 		 213 aa  208  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  53 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  52.5 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  48.34 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  47.47 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  46.54 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  49.07 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  49.07 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  49.07 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  51.94 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  48.61 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  49.07 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  48.79 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  49.76 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  49.76 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  50.24 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  48.86 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  51.46 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  49.04 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  45.89 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  43.56 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  46.63 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  42.45 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  38.42 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.57 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  46.67 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.18 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  35.03 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.52 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.52 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39 
 
 		 440 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.88 
 
 		 382 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.99 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  43.79 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.7 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>