More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3472 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  84.92 
 
 		 200 aa  314  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  46.46 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  43.15 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  45.23 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 225 aa  137  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.71 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  41.33 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  39.9 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  44.22 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  39.11 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.62 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  47.71 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  51.79 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  44.08 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  43.51 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  42.76 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  40.5 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  44.79 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.13 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  46.34 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  42.76 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  50.94 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  50.89 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.13 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  44.19 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  44.19 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  41.14 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.76 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  42.35 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  43.42 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  39.16 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  35.19 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  56.57 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.01 
 
 		 382 aa  88.6  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 370 aa  88.6  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  36.16 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.54 
 
 		 378 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  43.4 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.68 
 
 		 369 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  43.4 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  40.52 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  42.33 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.93 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  36.55 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>