More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1484 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  57.96 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  49.07 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.67 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  39.25 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  40.87 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  39.71 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  39.71 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  39.71 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  39.71 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  39.71 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  39.42 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 		 213 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 		 205 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.65 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  42.05 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  43.64 
 
 		 181 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.77 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  36.31 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 411 aa  92  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 440 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.3 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.27 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  37.21 
 
 		 198 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>