More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1414 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  41.62 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  34.02 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  38.55 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  37.95 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  37.95 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  37.95 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  37.95 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  37.95 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 216 aa  97.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  43.18 
 
 		 442 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  35.98 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  37.35 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  43.51 
 
 		 442 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  37.35 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  32.14 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 226 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 197 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.6 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 223 aa  87.8  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 223 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.73 
 
 		 442 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  35 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  33.53 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  33.53 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 448 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.73 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.48 
 
 		 442 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 405 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.87 
 
 		 442 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 370 aa  84.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.22 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.59 
 
 		 213 aa  84.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 240 aa  84.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.72 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.5 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.33 
 
 		 442 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>