More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0350 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
405 aa  841    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  57.86 
 
 
402 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  56.11 
 
 
402 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  52.84 
 
 
410 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0204  Phosphoglycerate mutase  47.68 
 
 
408 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  32.84 
 
 
456 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  32.28 
 
 
443 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  32.41 
 
 
540 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  31.95 
 
 
658 aa  167  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40330  predicted protein  31.64 
 
 
506 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85029  6-phosphofructose-2-kinase  27.41 
 
 
892 aa  134  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00430923  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05144  hypothetical protein similar to 6-phosphofructo-2-kinase (Eurofung)  26.65 
 
 
700 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8706  predicted protein  27.81 
 
 
398 aa  106  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866499  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10824  6-phosphofructo-2-kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05100)  25.8 
 
 
559 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05980  cytoplasm protein, putative  25.24 
 
 
605 aa  92.8  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.023684  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_3092  predicted protein  34.07 
 
 
240 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.760801  normal  0.0555608 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 
214 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 
214 aa  86.3  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
195 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.92 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 
214 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.92 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.58 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.21 
 
 
442 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.3 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.06 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57978  6-phosphofructo-2-kinase.  22.61 
 
 
547 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.19 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.81 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66347  6-phosphofructo-2-kinase  28.65 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283395  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.9 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
208 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
200 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
196 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.32 
 
 
207 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0124  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.69 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.57 
 
 
203 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
202 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
452 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.48 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.57 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.02 
 
 
213 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  31.76 
 
 
203 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.55 
 
 
547 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.42 
 
 
202 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
197 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
196 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
202 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 
198 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.38 
 
 
200 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.38 
 
 
200 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28 
 
 
203 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 
194 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.75 
 
 
200 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  28.42 
 
 
202 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  28.42 
 
 
213 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28 
 
 
205 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 
211 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
223 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28 
 
 
203 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
256 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
201 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 
205 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  28.42 
 
 
202 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.74 
 
 
206 aa  63.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 
196 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  34.78 
 
 
224 aa  62.8  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 
209 aa  63.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  31.85 
 
 
196 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>