More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0728 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  55.21 
 
 		 217 aa  230  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  54.69 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  54.92 
 
 		 194 aa  221  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  52.31 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  52.69 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  44.85 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  45.03 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.57 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  40.36 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  37.1 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.59 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.11 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  30.37 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  35.47 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 402 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  34.71 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  28.8 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  34.25 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  31.25 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  28.99 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>