More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2551 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
195 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
196 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
196 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
195 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
196 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  35.03 
 
 
199 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
196 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
197 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  34.72 
 
 
193 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 
191 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  32.12 
 
 
217 aa  101  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
197 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 
196 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
196 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.97 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.28 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.33 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  31.25 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.58 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.28 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.58 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.77 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.43 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  42.72 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  34.86 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.56 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.68 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  29.73 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.19 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.96 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
447 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  37.88 
 
 
459 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33.33 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.85 
 
 
442 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
448 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.85 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.83 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.42 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.1 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  27.53 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  29.31 
 
 
658 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
591 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.9 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  36.64 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  29.78 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  36.64 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  36.64 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
449 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>